MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-6 DNA

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020827	CT	3	6	10	15	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020827	CTT	2	6	48	53	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020827	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020827	TTTA	2	8	189	196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020827	A	7	7	424	430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020827	CTA	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020827	TAG	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020827	CTA	2	6	569	574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020827	T	6	6	690	695	0 %	100 %	0 %	0 %	472279763
10	NC_020827	CTT	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
11	NC_020827	T	7	7	785	791	0 %	100 %	0 %	0 %	472279763
12	NC_020827	TCA	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
13	NC_020827	CTAT	2	8	927	934	25 %	50 %	0 %	25 %	472279763
14	NC_020827	TAA	2	6	941	946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279763
15	NC_020827	TGC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279763
16	NC_020827	TA	3	6	1046	1051	50 %	50 %	0 %	0 %	472279763
17	NC_020827	TTG	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279763
18	NC_020827	TCT	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
19	NC_020827	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
20	NC_020827	CTT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
21	NC_020827	TACAT	2	10	1378	1387	40 %	40 %	0 %	20 %	472279764
22	NC_020827	T	7	7	1393	1399	0 %	100 %	0 %	0 %	472279764
23	NC_020827	CTTT	2	8	1490	1497	0 %	75 %	0 %	25 %	472279764
24	NC_020827	ATTTG	2	10	1507	1516	20 %	60 %	20 %	0 %	472279764
25	NC_020827	AAT	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
26	NC_020827	AAC	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279764
27	NC_020827	ATTGT	2	10	1594	1603	20 %	60 %	20 %	0 %	472279764
28	NC_020827	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279764
29	NC_020827	AAT	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
30	NC_020827	ACT	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279764
31	NC_020827	TCCC	2	8	1749	1756	0 %	25 %	0 %	75 %	472279765
32	NC_020827	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
33	NC_020827	CTA	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
34	NC_020827	T	6	6	1851	1856	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
35	NC_020827	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
36	NC_020827	CTA	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
37	NC_020827	TGCC	2	8	2102	2109	0 %	25 %	25 %	50 %	472279765
38	NC_020827	AT	3	6	2195	2200	50 %	50 %	0 %	0 %	472279765
39	NC_020827	T	7	7	2240	2246	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
40	NC_020827	TTAAT	2	10	2252	2261	40 %	60 %	0 %	0 %	472279765
41	NC_020827	CCA	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279765
42	NC_020827	T	6	6	2366	2371	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
43	NC_020827	TAA	2	6	2474	2479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
44	NC_020827	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
45	NC_020827	TC	3	6	2492	2497	0 %	50 %	0 %	50 %	472279765
46	NC_020827	TTA	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
47	NC_020827	CTGT	2	8	2555	2562	0 %	50 %	25 %	25 %	472279765
48	NC_020827	AAT	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
49	NC_020827	TTC	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279765
50	NC_020827	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
51	NC_020827	CGA	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279765
52	NC_020827	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
53	NC_020827	T	6	6	2922	2927	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
54	NC_020827	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
55	NC_020827	CAA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
56	NC_020827	AAT	2	6	3078	3083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
57	NC_020827	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
58	NC_020827	A	6	6	3135	3140	100 %	0 %	0 %	0 %	472279765
59	NC_020827	CAAA	2	8	3155	3162	75 %	0 %	0 %	25 %	472279765
60	NC_020827	GTAA	2	8	3234	3241	50 %	25 %	25 %	0 %	472279765
61	NC_020827	GAA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279765
62	NC_020827	A	7	7	3342	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	472279765
63	NC_020827	AAT	2	6	3399	3404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
64	NC_020827	ATC	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
65	NC_020827	AGGATC	2	12	3561	3572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472279765
66	NC_020827	TAA	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
67	NC_020827	CGT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
68	NC_020827	TCTA	2	8	3636	3643	25 %	50 %	0 %	25 %	472279765
69	NC_020827	CTGA	2	8	3818	3825	25 %	25 %	25 %	25 %	472279765
70	NC_020827	GCT	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
71	NC_020827	T	6	6	3959	3964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020827	CT	3	6	3967	3972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020827	TTC	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020827	AGT	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020827	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020827	ATT	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020827	TGG	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020827	GCT	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020827	GTT	2	6	4404	4409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020827	TA	3	6	4412	4417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020827	GATA	2	8	4444	4451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020827	A	6	6	4464	4469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020827	TA	3	6	4479	4484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020827	TA	3	6	4515	4520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020827	A	6	6	4680	4685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020827	T	7	7	4703	4709	0 %	100 %	0 %	0 %	472279766
87	NC_020827	CAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279766
88	NC_020827	GAA	2	6	4757	4762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279766
89	NC_020827	TA	3	6	4772	4777	50 %	50 %	0 %	0 %	472279766
90	NC_020827	T	6	6	4893	4898	0 %	100 %	0 %	0 %	472279766
91	NC_020827	AGT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
92	NC_020827	CAC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279766
93	NC_020827	AAAAT	2	10	5002	5011	80 %	20 %	0 %	0 %	472279766
94	NC_020827	TGT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279766
95	NC_020827	GT	3	6	5035	5040	0 %	50 %	50 %	0 %	472279766
96	NC_020827	TAAA	2	8	5094	5101	75 %	25 %	0 %	0 %	472279766
97	NC_020827	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
98	NC_020827	ATT	2	6	5117	5122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
99	NC_020827	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279766
100	NC_020827	A	7	7	5179	5185	100 %	0 %	0 %	0 %	472279766
101	NC_020827	TAT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
102	NC_020827	GTCT	2	8	5332	5339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020827	TACTT	2	10	5398	5407	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020827	CTA	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020827	TA	3	6	5451	5456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020827	AAC	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020827	ATGA	2	8	5592	5599	50 %	25 %	25 %	0 %	472279767
108	NC_020827	TGC	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279767
109	NC_020827	TTA	2	6	5619	5624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
110	NC_020827	TTTTA	2	10	5663	5672	20 %	80 %	0 %	0 %	472279767
111	NC_020827	TAA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279767
112	NC_020827	TTA	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
113	NC_020827	AAAAT	2	10	5995	6004	80 %	20 %	0 %	0 %	472279767
114	NC_020827	A	6	6	6101	6106	100 %	0 %	0 %	0 %	472279767
115	NC_020827	G	7	7	6187	6193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020827	A	8	8	6202	6209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020827	GTA	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020827	AAT	2	6	6267	6272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020827	CCTT	2	8	6276	6283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020827	CTT	2	6	6328	6333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020827	CTT	2	6	6340	6345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020827	ATA	2	6	6380	6385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020827	CAA	2	6	6474	6479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020827	TTACA	2	10	6543	6552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020827	A	6	6	6639	6644	100 %	0 %	0 %	0 %	472279768
126	NC_020827	AAT	2	6	6783	6788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279768
127	NC_020827	TTGTTC	2	12	6923	6934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472279768
128	NC_020827	CTA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279768
129	NC_020827	TTG	2	6	7019	7024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279768
130	NC_020827	TTCAC	2	10	7059	7068	20 %	40 %	0 %	40 %	472279768
131	NC_020827	GTA	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279768
132	NC_020827	TCG	2	6	7123	7128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
133	NC_020827	TTC	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279769
134	NC_020827	GTTT	2	8	7205	7212	0 %	75 %	25 %	0 %	472279769
135	NC_020827	CGT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
136	NC_020827	GCT	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
137	NC_020827	CAAC	2	8	7374	7381	50 %	0 %	0 %	50 %	472279769
138	NC_020827	GCT	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
139	NC_020827	GTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279769
140	NC_020827	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279769
141	NC_020827	GAT	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279769
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178	NC_020827	A	6	6	9750	9755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_020827	CAA	2	6	9856	9861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_020827	ACC	2	6	9872	9877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.